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中茶所等单位合作发布“龙井43”基因组

2020-10-09  作者: admin  来源: 未知  已阅读

Tea is an economically important plant characterized by a large genome, high heterozygosity, and high species diversity. In this study, we assemble a 3.26-Gb high-quality chromosome-scale genome for the ‘Longjing 43’ cultivar of Camellia sinensis var. sinensis(茶变种). 
 
 
 
Genomic rese-quencing of 139 tea accessions from around the world is used to investigate the evolution and phylogenetic relationships of tea accessions. 
 
 
 
We find that hybridization has increased the heterozygosity and wide-ranging gene flow among tea populations with the spread of tea cultivation. 
 
 
 
Population genetic and transcriptomic analyses reveal that during domestication, selection for disease resistance and flavor in C. sinensis var. sinensis populations has been stronger than that in C. sinensis var. Assamica(普洱茶变种) populations. 
 
 
 
This study provides resources for marker-assisted breeding of tea and sets the foundation for further research on tea genetics and evolution.
 
 
 
茶是一种重要的经济作物,其特征是基因组大,杂合度高和物种多样性丰富。在这项研究中,研究者组装了“龙井43”(茶变种)3.26 Gb的高质量染色体规模基因组。
 
 
 
来自世界各地的139个茶树种质的基因组重排用于研究茶树的进化和系统发育关系。我们发现随着茶栽培的普及,杂交增加了茶种群之间的杂合性和广泛的基因流动。
 
 
 
群体遗传和转录组学分析表明,驯化过程茶变种在抗性和风味比普洱茶变种受更强的选择。
 
 
 
该研究为标记辅助茶育种提供了资源,并为进一步研究茶树的遗传和进化奠定了基础。
 
 
 
 
 
 
 
 
这篇文章应该是茶树的第5篇基因组了,之前还有普洱茶变种“云抗10号”、茶变种“舒茶早”(有两版)和“碧云”,还有一份古茶树基因组,这些基因组测序的完成,将为茶树改良(品质、抗性)、遗传进化的研究提供基础。简单讲就是我们可以更深入的了解茶树的起源进化、可以使我们能够更快的培育出好的茶树品种,并能喝到口感香气更好的茶叶。
 
 
 
 
 
对于茶叶研究者来说大数据时代已经到了,但是并不是每个研究者都能利用好这些数据,因此需要一个汇总的数据库(数据库其实已经有一个了“TPIA”,但是还不够完美,数据的全面性、可利用性、以及交互性还不够),可以使研究者更好的利用数据,然后加速茶树基础以及应用研究。(集大成的数据库应该也不远了)
 
责任编辑:千鹤茶苗